saha类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的分子对接和3d-qsar研究 论文

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全部作者 ： 薛白 吉民 魏洪涛 陆爱军 刘健
第一作者单位 ： 东南大学生物科学与医学工程学院
论文摘要 ： 组蛋白去乙酰化酶（hdac）对癌细胞的抑制作用在近几年的癌症治疗临床试验中被一再验证。本文对一些saha类似物的三维定量构效关系（3d-qsar）研究是利用比较分子立场分析方法（comfa）对这些化合物的抑制作用进行的结构性分析来实现的。分子对接结果为3d-qsar模型提供了可靠的构象叠合。基于此分子叠合框架，comfa的交叉验证系数q2的值为0.684。非交叉验证分析证明有三个最佳主成分，非交叉验证系数 r2=0.948，f=127.023，标准误差为0.165。此外，把3d-qsar模型映射到hdlp的结合位点，能够更好地理解羟肟酸和锌离子重要的相互作用。通过分子对接和comfa分析，我们已经证实了一些组蛋白去乙酰化酶抑制剂能够具有抑制癌细胞活性的原因。此模型对设计更有效的组蛋白去乙酰酶抑制剂以及在合成之前预测它们的药效具有重要指导意义。
关键词 ： 三维定量构效关系；surflex-dock；比较分子力场分析；saha；saha类似物
发表日期 ： 2009年06月23日
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